知网查重论文被盗的原因主要有以下几点：一是学术不端行为，包括抄袭、篡改数据等；二是盗版行为，他人恶意复制他人论文进行发布；三是网络安全问题，个人信息泄露导致论文被盗用。为避免知网查重论文被盗，作者应加强学术道德意识，保护自己的学术成果，定期更新密码，避免个人信息泄露，避免使用公共网络上传论文等。

如何保护知网查重论文不被盗用？首先，作者应加强学术道德意识，严格遵守学术规范，杜绝抄袭等行为；其次，定期更改知网账号密码，避免被他人盗用；再者，不要在公共网络上上传论文，避免信息泄露；最后，及时发现盗用行为，向相关部门举报，维护自己的学术权益。只有做好这些措施，才能有效保护知网查重论文不被盗用。